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氣相色譜儀屬于精密檢測儀器，需要操作員具備良好的操作素養，對氣相色譜儀做好保養維護，才能讓儀器長時間維持在一個較好的運行狀態。作為氣相色譜儀基本的一個操作規程，在開關機的時候需要注意以下事項：
1、開機順序：先打開載氣（氮氣鋼瓶、氬氣鋼瓶、氦氣鋼瓶等載氣氣閥），再開空氣和氫氣（氫氣發生器或者氫氣鋼瓶、空氣發生器或者空氣鋼瓶），載氣壓力表有顯示后再打開氣相色譜儀電源開關，然后打開上位機電腦進行聯機操作
2、關機順序：試驗做完后按停止鍵，然后關閉氫氣和空氣（關閉氫氣發生器或者氫氣鋼瓶、空氣發生器或者空氣鋼瓶），這一步很重要，氫氣燃燒會產生水蒸氣，隨著檢測器溫度的降低，水蒸氣會凝結在檢測器中，損壞儀器，所以試驗完成后必須先關閉氫氣和空。關閉氫氣和空氣后就可以開啟降溫程序，等待儀器內部溫度降至50℃后就可以關閉氣相色譜儀了。
以上是實驗室里比較常用的氣相色譜儀機型的開關機程序規程，如果是配置了EPC模塊的氣相色譜儀，開機關機會由程序控制，不需要太過在意這些，但是還是要嚴格按照開關機程序來執行，養成良好的操作習慣能夠保證儀器良好的運行狀態。
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